Biosferni rezervat pokriva površino 3.060 hektarjev in je razdeljen na 5 con:
MORSKO OSREDNJE OBMOČJE
30-hektarsko morsko osrednje območje, ki ustreza popolnoma zaščitenemu območju morskega zavarovanega območja Miramar, ki ga upravlja WWF Italija v imenu Ministrstva za okolje. To območje ima status popolnoma zaščitenega območja, kar pomeni popolno prepoved vseh morskih dejavnosti, razen raziskovalnih in okoljsko-izobraževalnih dejavnosti, ki jih spodbujajo in izvajajo zaposleni v WWF.
MORSKO ROBNO OBMOČJE
90 hektarjev veliko morsko robno območje A, nekakšen zaščitni pas okoli osrednjega območja, ki ga je ustanovila Pristaniška uprava Trsta in v katerem sta profesionalni ribolov in sidranje prepovedana.
KOPENSKO ROBNO OBMOČJE
35 hektarjev veliko kopensko robno območje, ki ustreza državnemu parku Miramar in je pod jurisdikcijo Zgodovinskega muzeja in parka gradu Miramar: zelena pljuča na obrobju mesta, a hkrati tudi lokacija velikega zgodovinskega in kulturnega pomena ter glavna turistična atrakcija regije.
MORSKO PREHODNO OBMOČJE
Morsko prehodno območje, ki ustreza biološkemu varstvenemu območju “Miramar”, ki ga je vzpostavilo ministrstvo za kmetijstvo, se razteza od Križa do Barkovelj in obsega približno 1.500 hektarjev. Tukaj tradicionalni ribolov in ekstenzivno gojenje školjk omogočata trajnostno rabo morskih virov.
KOPENSKO PREHODNO OBMOČJE
Kopensko prehodno območje, ki obsega približno 1.400 hektarjev, sestavlja kraški rob, ki se razteza čez občini Trst in Devin Nabrežina. Območje vključuje dve območji Natura 2000 in tri majhne vasi (Križ, Prosek in Kontovel), ki jih je v preteklosti naseljevala slovenska manjšina. Na kraškem pobočju, med gozdovi in sredozemskim grmičevjem, ležijo značilni terasasti nasadi vinskih trt in oljk, obdani s suhozidi, ki so rezultat tisočletne umetniške vneme.